改革宗神学不断强调祈祷的重要性和果效。神创造和救赎我们，就是为了让我们可以与祂交通，而与神交通正是祈祷的目的。神透过启示跟我们说话，这包括了来自圣经的特殊启示和来自创造的普通启示。当圣灵令我们能够明白这种启示，知罪，又在我们心中作工，帮我们顺服，并且因所得的启示而喜乐时，祂也亲自跟我们说话。我们以祷告与神说话作为回应。祷告的内容包括神，我们自身，我们与神的关系和祂所创造的万事万物。
神统管一切与祷告真有果效这两个事实之间，并不存在冲突或矛盾。正如神预定进食是满足饥饿的方法，祂也预定祷告是让事情发生的方法。神甚至预定我们的祷告，令它们能与祂永恒的计划完全一致。神的主权印证我们有责任祈祷，两者并没有矛盾。
虽然神命令我们祷告，但这不是我们祈祷的唯一原因。另一个原因是：我们祷告因为我们需要完全倚靠神，需要祂和与祂的交通。至高的神管治万物，因此祂能够按祂的心意行事，我们祷告，希望祂会选择行有益于我们的事。在神借以实现祂的永恒计划的各种人类作为中，祈祷是其中一项最有力量和果效的，因为祈祷是呼求全能的神为了我们的好处而行事。就如雅各写道：“义人祈祷所发出的力量，是大有功效的”（雅五：16）。
祷告针对不同情况有不同形式和侧重点。因此，我们可以有多种不同而合理的方法，把圣经里有关祷告的教导总结起来。其中一个理解祷告的好方法是把它视为四个层面的活动，而神的子民可以独自（太六：5-6）及与其他信徒一起进行（徒一：14，四：24）这活动。我们可借着祈祷：1. 表达赞美与称颂；2. 以痛悔的心认罪和寻求宽恕；3. 为得到的益处而感谢；4. 为自己和他人祈求。主祷文（太六：9-13；路一一：2-4）包括了赞美，祈求和认罪；诗篇则示范了上述的祷告四元素。
祈求就是谦卑地承认我们既需要也信靠神，我们要倚靠祂至高的智慧和美善。在整本圣经中，这可说是祷告最为突出的一环（例如：创一八：16-33；出三二：31至三三：17；拉九：5-15；尼一：5-11，四：4-5,9，六：9,14；但九：4-19；太七：7-11；约一六：23-24，一七：1-26；弗六：18-20；雅五：16-18；约壹五：14-16）。像主祷文所示范，祈求与其他祷告方式，一般应该直接向天父发出，但是我们也可以向基督提出祈求（约一四：14），特别是有关救赎和医治的祈求（徒七：59；罗一○：8-13；林后一二：7-9）。虽然圣经里没有特别向圣灵发出的祈祷以供参考，但我们也可以向圣灵祈求，因为祂也是神。圣经强调圣灵会激发我们祷告和替我们祈祷（罗八：15,26）。我们向三位一体的神祈求，或者向三个位格的其中一位祈求属灵的福气，绝对不是错误的。不过，跟从新约圣经的普遍模式总是智慧的做法。
根据耶稣的教导，向天父提出的祈求要奉耶稣的名而求（约一四：13-14，一五：16，一六：23-24）。此举即是以耶稣的成就作为我们可以接近天父的基础，并且求耶稣帮助，在天父面前为我们代求。不过，只有当我们照着神的旨意求（约壹五：14）和出于正确的动机去求（雅四：3），我们才可以期望得到耶稣的帮助。
耶稣教导说，当我们把所需要的带到神面前时，我们可以迫切和持续地恳求（路一一：5-13，一八：1-8），而祂也会答允这种祈祷。可是我们必须记着，深知道什么才是最有益于我们的神，或许会拒绝我们某些特别的祈求，因为祂知道怎样做才能满足我们的需要。要是神不答允我们的祈求，这是因为祂为我们预备了更好的，正如神拒绝医治保罗身上的刺（林后一二：7-9）。
抱着诚恳，敬虔，谦卑和忏悔的态度，以蒙神恩宠和纯洁的心来祷告的基督徒，将发现在圣灵激发下，他们会更常祷告，并且心里自然地信靠天父（罗八：15；加四：6）。即使他们不知道要在祷告里说什么或求什么，他们也会觉得不得不祈祷（罗八：26-27）。只有经常祈祷的人，才能体会圣灵在祷告中给予帮助这个奥妙的事实。
