科学（Science）一词，意即知识。《韦氏大辞典》有几个定义，其中一个最简单明了的是：“科学是自然物质界的系统知识”。故凡超乎自然物质界的知识，如宗教、灵界，就不属科学范围，而是属神学范围。神学研究的对象不是物质，当然是不能用探究物质的方法来探究。
同一层次的知识，彼此连系，才可以系统化。科学与神学既非同一层次，彼此系统化便有困难。但它们有一个共同的挂钩，那是来源问题，也即创造问题。神学探讨“创造之主”，科学探究“受造之物”。二者可说都以“创造”为出发点。若无创造，便无万物，包括人类，那么科学与神学皆无可能。我们生活在自然世界中，较易了解物质基层的知识，对灵界高层的知识，则较难明白。
科学是利用感官、理智、工具与仪器，探究自然万物的工作。人的感官功能有限，必须用工具和仪器辅助。但同时，人在工作上，也反映了他的弱点，例如：无能、偏见、虚浮、主观、自私与夸张等。人不是万能，所造的工具亦不可能万能。因此科学也不是万能。
科学精神
从事科学的人，必须自认所知极少，再而驱除成见，实事求是，虚心地求证，严谨地治学，锲而不舍，直至认知。但单就这一方面来说，也不容易做到。因为每一个人有意或无意，都有自己的世界观，对客观资讯的评估，多少受到先入为主的世界观影响。并且人容易冲动，流于肤浅，所以常见不少人狂热，偏向这方面或那方面；例如大喊“科学万能”、“双手万能”者，就是一例。
科学假设
科学家假设在自然物质界中，有一致的自然规律，叫作“自然划一原则”（PrincipleofUniformityofNature），亦即自然律不因时间、空间、观察，或实验的人而变。换言之，相信自然物质界有固定的秩序，否则，客观上便无探究的可能。科学又假设，自然界的奥秘是人可以理解的，否则主观探究便无法起步。规律与秩序是设计的表现；设计必需有设计者。自然界能被理解，就表明了它由最高的理智（即神的理智）而创造。无理智的产物非人所能理解，例如一只小鸟，不管它在白纸上留下多少脚印，我们都无法知其所云。
科学方法
科学观察和实验，使用度、量、衡为客观标准。凡不能用客观定量考究的，严格地说都不属科学范围。例如精神抽象方面的爱、恨、善、恶、怯弱、勇敢等等，都不能客观作“量”的测定，只能主观作“质”的形容。
至于理解方面，需要在没有政治或人事压力下，才可根据逻辑自由思考、讨论、归纳或演绎；这就是为什么自由社会有利于科学发展的原因。若是政治干涉知识，凡政权不悦的，即使是事实，也不容发表，那么求知的事业，便难于运作。
科学的目标
科学的目标是寻求自然系统中的事实及原因，不涉及超自然。但不涉及超自然，并不等于否认超自然。这点许多人都弄糊涂，所以才有唯物论者以偏盖全的现象。
正因为科学探究要求严谨，所得的讯息清晰明确，所以科学探究的范围甚窄小。而即使如此，科学知识仍不是永恒不变的真理；它有随时被推翻或修正的可能。这便是科学知识的“暂时性”。二十世纪最杰出的科学哲理家朴柏（KarlPopper），已清楚给我们解释，科学归纳法所得的“定律”，虽由百万个事实支持，仍只能如采样法（Sampling）得出简略性的结果，不能保证永无例外情形。科学发现的事实却可推翻已有的理论。尚未推翻的理论，算为“暂作此论”；尚未推翻的定律，则作为“近似真实”。故此，欲在科学中寻求永恒不变真理，必招致失望。
科学只能知道：自然万物是“怎样的”；不能知道“怎么会这样”。笔者年轻时，在中国上大学一年级化学课，听一位留学美国化学博士教授大谈化学原素周期表，他对原子构造与性质的秩序与周期性甚为详熟，但下课后，一个同学问他：“怎么会这样？”他便瞠目答不上来。类似的问题，例如：“为什么人只有两只眼睛、两只脚？”“为什么人没有翅膀？”“为什么兔子不能像牛那般大？”“为什么马不能像猫那么小？”千千万万个“为什么”，都是科学不能解答的。惟有圣经告诉我们：“……万物是因祂（上帝）的旨意被创造而有的”（启示录四11）。只有神自己才能给我们最后答案。
科学家可以在大自然的体系中，追究彼此的关系与原因，但对整个大自然的存在，即最终的来源问题，便无法探讨。这好比研究一所房子的结构，可以知道建造的先后次序，却永远找不到建造房子的工程师。根据常理与逻辑推断，必有一位设计的工程师在先，而这位设计、建造宇宙的工程师，便是基督徒所敬拜的创造者。
基督徒敬拜“独一真神”，相信宇宙的一元性，作为科学寻求划一定律的心理基础，因而帮助了科学寻求普通定律的发展，这是历史事实；也是东方多神信仰文化土壤培植不出科学的原因。
科学需要逻辑思想作归纳或演绎，前已提及，逻辑思想即理性的正当运作，如古希腊人所发展的。法国哲学家勒农（Renan）说：“一个人的心意未直接或间接纳入希腊的纪律，便缺乏了正当训练。”当基督教在犹太兴起之后，以宗教本位的希伯来民族思想，与以理性为本位的希腊民族思想，起了调和作用。因为希腊传统的多神信仰，已为哲学思想家所否定，“毁灭干净”（注一）。胡适之先生说：“相当于中国汉朝以后，犹太系加入希腊系，成了欧洲的中古哲学”（注二）。屠正叔说：“……试考欧化发达之本末及其精神所在，乃知希伯来之思想不独不为学术进步之阻碍，且实有助长之大功焉。”（注三）
最显着的例子是基督教神学的发展，以理智探讨信仰，即“以理证信，以信辅理”。理性为人体功能之一，有其限度。理性不足时，需要信仰辅助。反之，古代神话或迷信受希腊理性考验后，便无法立足。历史家说：“罗马帝国起初的三个世纪……希腊与罗马的旧宗教都已失去生机，虽然形式仍然维持，谁也不真相信朱庇特（Jupiter）及他的诸神明。企图以皇帝及国家为中心的宗教也失败了。”（注四）
亚力山大大帝以后数百年间，希腊文化──语文、艺术、科学、哲学，远播南欧、中东、北非，成为国际性新文化，称为“希腊化的文化”（HellenisticCulture）。犹太国便在其影响范围内。第一世纪最杰出的基督教宣教士使徒保罗，深受希腊文化薰陶，理性极强。在他所写的书信及讲道中，皆已呈露。他驳斥伊比鸠鲁（Epicurus,B.C.342-270）派，主张人生只以追求快乐为目的的论调；也驳斥斯多亚（Stoicism）派克制情欲，置苦乐生死于度外，以理智追求至善的论调。这二派是当时盛行的哲学（参使徒行传十七18）。他以宇宙万物，作为神存在及具有大能的具体实证。既有“所造之物”，必有“造物之主”；叫人无法否认，神即是造物之主。
虽然保罗的理性极强，但他不是理性主义（Rationalism）者。他在大马色路上，有很不寻常的经验，令他从反对基督的福音，转变为不顾性命传扬福音。但他又不是经验主义（Empiricism）者，而是极重“信”的人。他在名重一时的律法师迦玛列门下受教，一生勤读不倦，知识极为丰富。但他又不高举知识，反而着重爱心。因为他所传的是真理。真理与理性、经验、知识，都可沾边，但不偏于一方。后来中世纪的教会领导或神学家，也因同受希腊文化的薰陶，理性强劲。历史家说：“中世纪欧洲最富创作性的思想家，皆出自教会。例如罗介培根（RogerBacon）与阿奎那（ThomasAquinas），他们醉心于学术的冲力，即来自对基督耶稣的献身”（注五）。中世纪教会有“文明堡垒”之誉，神学被尊为“百科之后”。
近四世纪以来，现代科学的发展，可追溯到欧洲中世纪基督教大学中的教师（Schoolman）。他们继希腊之后，首次再以客观理性，严谨探讨自然万物，重视思想合理化，并锲而不舍、潜心研究的精神，奠定现代科学的基础。特别是英国牛津的方济各会（Fransiscan）学者，在光学的实验中，给物理学带来了新趋势。再经过十四、十五世纪的努力，直至意人加利略（Galileo,1564-1642），成为高潮，被视为现代科学家的第一人。继来杰出的科学家，多数信仰基督，如：
一.克卜勒（JohannKepler,1571-1630）被认为天文学的创始人，证明太阳中心说。他说他只是“思神之所思”，跟进神之思路而已。
二.培根（FrancisBacon1561-1626）的贡献是强调实验，由数据归纳的“科学方法”。他说：“我们有两部书可以学习，以免谬误。一本是圣经，启示神的旨意。另一本为造物，彰显祂的大能。”
三.巴斯加（BlaisePascal,1623-62）为大数学家，创动水力学及静水力学，发明气压计，贡献甚多。他说：“作基督徒必不亏本，即使他死时发觉没有上帝，徒然相信，他仍无所失，因为他在世已较同伴们活得更快乐。但是，若有上帝及天堂地狱，那么，他得了天堂，他的同伴则一切消灭在地狱中。”
四.波义耳（RobertBoyle1627-91）是现代化学鼻祖，皇家学会的创办人之一，发现气体力学原则。他是个虔诚的基督徒与圣经学者，以经济支持翻译圣经及宣教事业。
五.雷伊（JohnRay1627-1705）为美国自然历史鼻祖，当时动植物学的权威，着书阐扬创造论，反对笛卡儿（Descartes,1596-1650）的机械说。
六.牛顿（IsaacNewton,1642-1727）发现万有引力，以公式说明运动三定律。发展微积分，又在光学上贡献很大，制第一架反射望远镜。他是个圣经学者，对圣经预言有特别的心得。
七.林奈（CarolusLinnaeus,1707-78）是生物分类学鼻祖。他是很虔诚的基督徒，相信各种生物皆为上主创造，而非唯物进化。
八.莱布尼兹（GattfriedW.Leibnitz1646-1716）是极具才干的数学家与哲学家，与牛顿同时发现微积分，他认为现在的物质世界为各种可能性中之最佳选择。
九.柏金森（JamesParkinson,1755-1824）在医学界很有贡献，柏金森病因他发现而以他为名，他有许多证道文章。
十.法拉第（MichaelFaraday,1791-1867）世界公认他是最大科学家之一，发展电学与磁学，在教会中活跃事奉，他说：“惟有圣经，不加不减，是每人在各样境况中独一充分的向导。”
十一.邱维埃（GergesCuvier,1769-1832）是伟大的解剖学及古生物学家，是创造论的健将。
十二.道尔顿（JohnDalton,1766-1844），现代原子学说的倡导者，在气象学中也有大贡献，也是发现色盲的人，是一位虔诚的信徒。
十三.阿加西（LouisAgassiz,1807-73）是一位古生物学家，对鱼类研究有杰出的成就，坚信圣经的学者。
十四.巴斯德（LouisPasteur,1822-95）是杰出的细菌学家，第一个认为细菌为致病的原因。是虔敬神的人。
十五.克尔文（WilliamThompson,LordKelvin,1842-1907）他在物理及数学上的贡献几与牛顿及法拉第并驾齐驱；这三位都是笃信圣经的人。克尔文是第一个采用“能”的观念的科学家。
十六.马克士威（JosephClarkMaxwell,1831-79）是笃信圣经的学者，在电磁场理论有卓越贡献。
等等杰出科学家不胜枚举。欧洲首创从事科学研究的伦敦皇家学会（RoyalSociety），初期会员中百分之九十为基督徒，而当时社会中基督徒仅占人口百分之二十。
除历史人物外，今日世界各国的科学家有基督信仰，从事科技研究或教育者，比比皆是，他们可以一方面探究自然之奥秘，一方面赞美创造主造物之大智大能；科学与神学携手并进。前者究察神之工，知道造物主的存在；后者领悟神之言，接受天父的训诲。
注一：《西方哲学史话》（威尔多兰着，杨荫渭、杨荫鸿译）。
注二：《东西文化及其哲学》（梁漱溟讲）第十二页。
注三：同上，附五十七页。
注四：TheCourseofCivilization,P.142（Strayer,Gatzde&Harbison.）
注五：《宣教事业与近代中国》（魏外扬），第一六零页。
